Имущественный налоговый вычет при приобретении квартиры налогоплательщиком - участником накопительно-ипотечной системы жилищного обеспечения военнослужащих (в рамках Федерального закона от 20.08.2004 № 117-ФЗ) может быть применен к общей сумме расходов налогоплательщика на приобретение квартиры, уменьшенных на сумму денежных средств, полученных налогоплательщиком на приобретение квартиры из федерального бюджета.
В случаях, когда налогоплательщик реализовал свое право на получение вычета, а впоследствии досрочно уволился с военной службы и вернул выплаченные из федерального бюджета суммы, корректировка предоставленного ему имущественного вычета в сторону увеличения не производится.
При этом налогоплательщик вправе заявить имущественный вычет в части расходов, произведенных им за счет собственных средств, на погашение процентов по жилищному займу.
Такие разъяснения даны в письме ФНС России от 30.01.2014 № БС-4-11/1562@.