Если индивидуальный предприниматель состоит на учете в разных налоговых органах (по месту осуществления деятельности на УСН и деятельности на патенте), то НДФЛ, удержанный из доходов работников, ИП перечисляет в следующем порядке:
- с доходов, выплачиваемых работникам, занятым в деятельности на УСН, - по месту жительства ИП;
- с доходов, выплачиваемых работникам, занятым в деятельности на патенте – по месту учета ИП в качестве плательщика УСН на патенте.
См. письмо ФНС России от 31.05.2012 № ЕД-4-3/8971@.