В случае если бракованный товар возвращается покупателем продавцу, то согласно Правилам ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, применяемых при расчетах по налогу на добавленную стоимость, утвержденных Постановлением Правительства Российской Федерации от 26.12.2011 № 1137, при возврате товаров, принятых на учет покупателем - налогоплательщиком налога на добавленную стоимость, НДС не восстанавливается, а продавцу покупателем выставляется счет-фактура по возвращенным товарам и, соответственно, при передаче таких товаров начисляется налог. Покупатель регистрирует этот счет-фактуру в книге продаж, а продавец – в книге покупок. См. письмо Минфина РФ от 29.11.2013 № 03-07-11/51923.
При возврате покупателем продавцу бракованных товаров корректировочный счет-фактура на уменьшение количества товаров составляется продавцом только в случаях, когда покупатель товаров не является плательщиком НДС. Корректировочный счет-фактуру продавец регистрирует в книге покупок. При этом если возвращается вся партия товаров, то продавец не составляет корректировочный счет-фактуру, а в книге покупок регистрирует счет-фактуру, который при отгрузке был зарегистрирован в книге продаж. См. письмо ФНС России от 14.05.2013 № ЕД-4-3/8562@.