Федеральная налоговая служба в письме от 28.07.2014 № ЕД-4-2/14546 рассмотрела ситуацию, когда отгрузка произведена в последний день квартала, а файл с документами в электронном виде отправлен покупателю 15 числа месяца, следующего за кварталом.
В соответствии с п. 3 ст. 168 НК РФ счета-фактуры выставляются не позднее пяти календарных дней, считая со дня отгрузки товаров (работ, услуг, имущественных прав). Порядок определения даты выставления и даты получения счета-фактуры в электронном виде предусмотрен пунктами 7 и 11 Правил ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, применяемых при расчетах по НДС (утв. Постановлением Правительства РФ от 26.12.2011 № 1137).
В описанной выше ситуации в отношении товаров, отгруженных в последний день квартала, регистрация продавцом счета-фактуры в книге продаж производится в том квартале, в котором произошла их отгрузка. При этом на основании п. 7 Правил ведения журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур в части 1 журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур указанный счет-фактура будет зарегистрирован в следующем квартале.
Согласно п. 2 Правил ведения книги покупок, применяемой при расчетах по налогу на добавленную стоимость (утв. Постановлением Правительства № 1137), счета-фактуры, полученные покупателем и зарегистрированные в части 2 журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур, регистрируются в книге покупок по мере возникновения права на налоговые вычеты в порядке, установленном ст. 172 НК РФ.
Соответственно, если счет-фактура составлен продавцом в одном налоговом периоде, а получен покупателем в следующем налоговом периоде, то при условии принятия на учет товаров (работ, услуг) вычеты сумм налога следует отражать в декларации за тот налоговый период, в котором счет-фактура фактически получен.