Федеральная налоговая служба России письмом от 25.10.2013 № ЕД-4-3/19224 довела до сведения налоговых органов и налогоплательщиков письмо Минфина РФ от 01.10.2013 N 03-07-15/40629 по вопросу применения налога на добавленную стоимость при вывозе медицинской техники из Российской Федерации в Республику Казахстан и Республику Беларусь.
Применение НДС в рамках Таможенного союза, членом которого являются Российская Федерация, Республика Казахстан и Республика Беларусь, осуществляется в соответствии с Соглашением о принципах взимания косвенных налогов при экспорте и импорте товаров, выполнении работ, оказании услуг в Таможенном союзе от 25.01.2008 г. и Протоколом о порядке взимания косвенных налогов и механизме контроля за их уплатой при экспорте и импорте товаров в Таможенном союзе от 11.12.2009 г.
В соответствии со статьей 2 Соглашения при вывозе товаров с территории одного государства - члена Таможенного союза на территорию другого государства - члена Таможенного союза применяется нулевая ставка НДС при условии подтверждения факта экспорта.
Как указано в письме Минфина, особенностей применения налога на добавленную стоимость при вывозе товаров, операции по реализации которых освобождены от налогообложения этим налогом на основании норм налогового законодательства государств - членов Таможенного союза, положениями Соглашения и Протокола не предусмотрено.
В связи с тем, что статьей 7 НК РФ установлен приоритет норм международных договоров Российской Федерации по вопросам налогообложения по сравнению с нормами законодательства Российской Федерации, при вывозе из Российской Федерации в Республику Казахстан и Республику Беларусь медицинской техники, операции по реализации которой в соответствии с п. 2 ст. 149 НК РФ освобождены от налогообложения НДС, применяется нулевая ставка налога на добавленную стоимость.
Соответственно, для применения указанной ставки налогоплательщикам необходимо подтверждать экспорт медтехники в страны Таможенного союза.