Организации, применяющие упрощенную систему налогообложения, с 1 января 2013 года должны вести бухгалтерский учет и, соответственно, представлять в налоговые органы бухгалтерскую отчетность в общеустановленном порядке. Об этом говорилось еще в письме Минфина России от 23.10.2012 № 03-11-09/80. При этом согласно пункту 6 приказа Минфина России от 02.07.2010 № 66н "О формах бухгалтерской отчетности" организации - субъекты малого предпринимательства вправе формировать отчетность по упрощенной системе.
Одновременно в письме сообщается, что с 1 января 2013 года на основании подпункта 5 пункта 1 статьи 23 НК РФ организации должны представлять в налоговые органы по месту своего нахождения только годовую бухгалтерскую (финансовую) отчетность.