Закрытый перечень случаев, при наступлении которых налогоплательщик считается утратившим право на применение патентной системы налогообложения и перешедшим на общий режим налогообложения с начала налогового периода, на который ему был выдан патент, содержится в п. 6 ст. 346.45 НК РФ.
Суммы налогов, подлежащие уплате в соответствии с общим режимом налогообложения за период, в котором индивидуальный предприниматель утратил право на применение ПСН, исчисляются и уплачиваются в порядке, предусмотренном зарегистрированных индивидуальных предпринимателей (п. 7 ст. 346.45 НК РФ).
При этом сумма НДФЛ, подлежащая уплате за налоговый период, в котором индивидуальный предприниматель утратил право на применение ПСН, уменьшается на сумму налога, уплаченного в связи с применением спецрежима.
ФНС России в письме от 12.08.2014 № ПА-4-11/15831 рекомендует до утверждения новой формы налоговой декларации по налогу на доходы физических лиц и порядка ее заполнения индивидуальным предпринимателям, утратившим право на применение патентной системы налогообложения, учитывать суммы налога, уплаченного в связи с применением патентной системы налогообложения, посредством уменьшения на них рассчитанных в декларации сумм налога на доходы физических лиц, подлежащих уплате (доплате) в бюджет (возврату из бюджета), и отражать по строкам 100 (110) раздела 1 декларации только итоговые скорректированные суммы. Кроме этого, одновременно с представлением декларации рекомендуется направлять в налоговый орган пояснительную записку с указанием в ней произведенных налогоплательщиком расчетов, по которым суммы НДФЛ, подлежащие уплате (доплате) в бюджет (возврату из бюджета), исчислены налогоплательщиком с применением положений абз. 2 п. 7 ст. 346.НК РФ, и иную значимую, по мнению налогоплательщика, информацию.